279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1650 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 537 aa  1064    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  42.3 
 
 		 533 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  41.26 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  40.25 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  36.98 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2991  flagellar M-ring protein FliF  38.45 
 
 		 532 aa  292  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  38.5 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  37.2 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  35.45 
 
 		 513 aa  259  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.74 
 
 		 525 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  32.45 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.35 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  30.29 
 
 		 522 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.38 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.26 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 587 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 587 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 587 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.71 
 
 		 587 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.52 
 
 		 587 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  33.01 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.25 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  29.33 
 
 		 527 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 600 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  35.52 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 		 603 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 		 598 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 677 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 598 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 598 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.6 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.43 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.83 
 
 		 593 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  31.51 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  30.13 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  29.6 
 
 		 528 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  30.33 
 
 		 563 aa  193  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.86 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.4 
 
 		 539 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.08 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.93 
 
 		 565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 		 552 aa  190  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.26 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.61 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  29.61 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  28.86 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.01 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.09 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.79 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.38 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  28.17 
 
 		 512 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  29.38 
 
 		 547 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.51 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  27.2 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.25 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  27.2 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  30.72 
 
 		 567 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  27.2 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  28.23 
 
 		 569 aa  181  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.36 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  30.09 
 
 		 563 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  26.2 
 
 		 568 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  29.86 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 		 598 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  29.85 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.56 
 
 		 567 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  28.92 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  29.45 
 
 		 560 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  29.03 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.69 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  27.17 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.69 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  28.29 
 
 		 576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  29.41 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  28.98 
 
 		 592 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.14 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  30.29 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  28.55 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 		 558 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>