265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2027 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
534 aa  1069    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  60.34 
 
 
530 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2991  flagellar M-ring protein FliF  44.92 
 
 
532 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  36.2 
 
 
559 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  39.45 
 
 
527 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  37.02 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  36.2 
 
 
531 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  36.45 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.69 
 
 
525 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  33.97 
 
 
513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  31.77 
 
 
530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  29.06 
 
 
528 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.65 
 
 
587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.32 
 
 
519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 
521 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.66 
 
 
519 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  32.44 
 
 
587 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  32.44 
 
 
587 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 
587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 
587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 
587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.22 
 
 
533 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  28.65 
 
 
548 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
498 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  31.59 
 
 
552 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.76 
 
 
537 aa  206  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
600 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.33 
 
 
512 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  28.95 
 
 
527 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  32.23 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.8 
 
 
603 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  30.86 
 
 
518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.16 
 
 
677 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  33.83 
 
 
500 aa  199  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.65 
 
 
551 aa  199  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.09 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.5 
 
 
523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 
593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
567 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  29.31 
 
 
522 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
598 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.05 
 
 
551 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 
568 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 
611 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 
611 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.17 
 
 
567 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.5 
 
 
537 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  30.99 
 
 
561 aa  189  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  28.91 
 
 
611 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  28.79 
 
 
552 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
552 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  29.13 
 
 
579 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 
552 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
552 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
552 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 
552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 
538 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  30.75 
 
 
541 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 
552 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 
524 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 
594 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.72 
 
 
590 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 
538 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 
576 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.68 
 
 
544 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 
539 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  29.68 
 
 
544 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  28.17 
 
 
588 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  30.08 
 
 
540 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  26.62 
 
 
569 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  29.12 
 
 
547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  30.71 
 
 
535 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  28.11 
 
 
563 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 
539 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  26.72 
 
 
568 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  29.95 
 
 
565 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  30.42 
 
 
532 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  34.1 
 
 
563 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  29.01 
 
 
571 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  29.2 
 
 
532 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 
580 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 
565 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  29.52 
 
 
567 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  29.96 
 
 
552 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  26.63 
 
 
566 aa  170  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  26.48 
 
 
569 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  27.9 
 
 
529 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>