259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04973 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  91.59 
 
 		 569 aa  1037    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 583 aa  1183    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  45.69 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  46.18 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  46.31 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  45.65 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  44.96 
 
 		 565 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  44.57 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  39.7 
 
 		 559 aa  349  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0250  flagellar MS-ring protein  36.79 
 
 		 548 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  37.88 
 
 		 546 aa  332  9e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  37.88 
 
 		 546 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  37.63 
 
 		 546 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3382  flagellar MS-ring protein  37.17 
 
 		 548 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.275908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 		 556 aa  316  9e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  36.69 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  35.09 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  32.55 
 
 		 568 aa  289  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.93 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.99 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 		 597 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0223  flagellar MS-ring protein  36.31 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  32.18 
 
 		 592 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.46 
 
 		 590 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  32.18 
 
 		 592 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.83 
 
 		 592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.05 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  32.41 
 
 		 594 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  31.94 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  32.41 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  31.83 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 		 544 aa  264  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  31.83 
 
 		 592 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  32.08 
 
 		 552 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  31.03 
 
 		 552 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.97 
 
 		 580 aa  253  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  30.91 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  32.45 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 		 548 aa  239  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 		 611 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 		 611 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 		 567 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  34.24 
 
 		 584 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.65 
 
 		 576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.89 
 
 		 562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 		 595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 		 603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.31 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 		 566 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 		 600 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.48 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  33.13 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  32.28 
 
 		 593 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.99 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.43 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 677 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  28.33 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.56 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  32.7 
 
 		 563 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.25 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.25 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.25 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  30 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 		 569 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  30.69 
 
 		 565 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 		 560 aa  216  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  30.22 
 
 		 566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  31.8 
 
 		 563 aa  214  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 552 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  30.48 
 
 		 586 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  32.56 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>