266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5126 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  69.14 
 
 
538 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  83.39 
 
 
541 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
539 aa  1048    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  68.5 
 
 
525 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  69.63 
 
 
540 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  69.81 
 
 
540 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  51.1 
 
 
540 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  51.85 
 
 
541 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  52.5 
 
 
538 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  51.57 
 
 
532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  51.02 
 
 
535 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  50.92 
 
 
532 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  51.21 
 
 
539 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  46.57 
 
 
552 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  38.67 
 
 
551 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  37.23 
 
 
551 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  37.39 
 
 
547 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
522 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  34.29 
 
 
527 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  34.2 
 
 
525 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.65 
 
 
527 aa  279  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  34.3 
 
 
530 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  35.53 
 
 
520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
523 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  35.5 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.87 
 
 
528 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  34.97 
 
 
542 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  34.79 
 
 
509 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  36.28 
 
 
543 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  35.3 
 
 
587 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  35.75 
 
 
593 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.09 
 
 
590 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  30.93 
 
 
551 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  32.9 
 
 
539 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  35.33 
 
 
587 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  34.15 
 
 
600 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  35.33 
 
 
587 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  37.44 
 
 
538 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.42 
 
 
519 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  37.6 
 
 
537 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  37.44 
 
 
539 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  35.32 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  35.09 
 
 
595 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  39.15 
 
 
598 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  39.15 
 
 
598 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.77 
 
 
603 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.85 
 
 
587 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
677 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  39.15 
 
 
598 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 
526 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  38.08 
 
 
587 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  38.08 
 
 
587 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  38.08 
 
 
587 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  37.28 
 
 
571 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.25 
 
 
580 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  34.4 
 
 
552 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 
611 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 
611 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 
553 aa  223  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 
569 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.76 
 
 
594 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 
563 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  33.48 
 
 
572 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 
558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  35.56 
 
 
563 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  35.7 
 
 
560 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  36.45 
 
 
552 aa  216  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.31 
 
 
567 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  36.45 
 
 
552 aa  216  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  36.45 
 
 
552 aa  216  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  36.45 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  36.45 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  32.8 
 
 
611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.16 
 
 
533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.99 
 
 
598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  36.21 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.78 
 
 
597 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.54 
 
 
592 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  36.95 
 
 
547 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.93 
 
 
576 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 
592 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 
567 aa  213  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 
592 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  31.62 
 
 
567 aa  212  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  34.3 
 
 
548 aa  212  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 
579 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  30.54 
 
 
565 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
519 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  33.52 
 
 
576 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.72 
 
 
579 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
579 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
579 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
576 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 
565 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  35.95 
 
 
568 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 
579 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>