250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2745 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  80.04 
 
 		 509 aa  790    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 543 aa  1068    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  79.85 
 
 		 542 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  47.32 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  46.88 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  45.39 
 
 		 583 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  49.44 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  36.36 
 
 		 552 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  34.62 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  34.34 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  35.98 
 
 		 539 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  33.94 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  34.28 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  34.28 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  32.89 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 		 551 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  36.36 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  33.39 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 		 551 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.11 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  32.53 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 547 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  32.52 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 		 590 aa  197  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.04 
 
 		 525 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  32.08 
 
 		 547 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  30.4 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.94 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.75 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.34 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  31.97 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.19 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  31.06 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  29.74 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  33.25 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  31.24 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  31.16 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 603 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.62 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  30.43 
 
 		 523 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.4 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  33.73 
 
 		 552 aa  171  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.34 
 
 		 528 aa  170  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 544 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  32.18 
 
 		 567 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.76 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.46 
 
 		 587 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.73 
 
 		 677 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  34.38 
 
 		 580 aa  163  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  31.35 
 
 		 559 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  31.35 
 
 		 559 aa  163  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 587 aa  163  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 		 546 aa  163  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  28.21 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  30.7 
 
 		 529 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.61 
 
 		 587 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  28.46 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.81 
 
 		 595 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.61 
 
 		 587 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  31.32 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  29.49 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.85 
 
 		 576 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.04 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.04 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  30.85 
 
 		 561 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 		 594 aa  157  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.85 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 579 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 		 568 aa  156  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 		 580 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  27.88 
 
 		 519 aa  153  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.99 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  26.23 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.82 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>