287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0305 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  74.87 
 
 
568 aa  848    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  71.94 
 
 
557 aa  805    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
563 aa  1132    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  97.51 
 
 
563 aa  1088    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  48.22 
 
 
545 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  42.33 
 
 
553 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  44.48 
 
 
579 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  43.87 
 
 
580 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  43.99 
 
 
568 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  39.73 
 
 
572 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  41.18 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  42.34 
 
 
546 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  40.25 
 
 
546 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  40.14 
 
 
544 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  37.57 
 
 
559 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  37.57 
 
 
559 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  37.91 
 
 
570 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 
551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.48 
 
 
541 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  30.95 
 
 
540 aa  210  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 
532 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  32.04 
 
 
552 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32.97 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 
535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  30.94 
 
 
532 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.78 
 
 
600 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 
551 aa  193  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 
520 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.62 
 
 
611 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 
587 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.62 
 
 
611 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 
587 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 
587 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  30.69 
 
 
541 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  33.9 
 
 
587 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 
593 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  30.72 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 
539 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  31.93 
 
 
540 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  31.93 
 
 
540 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
538 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.42 
 
 
603 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 
587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  29 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  28.48 
 
 
539 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.95 
 
 
530 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  33.5 
 
 
587 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.5 
 
 
587 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  31.98 
 
 
562 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  34.35 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  34.35 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  34.35 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 
542 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  30.34 
 
 
539 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 
584 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  34.35 
 
 
677 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  28.6 
 
 
597 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
525 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  29.25 
 
 
592 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 
571 aa  177  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  30.65 
 
 
527 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  30.4 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  29.45 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  28.1 
 
 
598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  27.22 
 
 
590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.35 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  28.86 
 
 
547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.33 
 
 
533 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.94 
 
 
523 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  32.2 
 
 
509 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.33 
 
 
504 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.22 
 
 
519 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  27.96 
 
 
611 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  28.95 
 
 
592 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  28.95 
 
 
592 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.2 
 
 
528 aa  170  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  29.66 
 
 
552 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.9 
 
 
552 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  27.43 
 
 
565 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
552 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.35 
 
 
561 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
552 aa  169  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
552 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 
538 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  27.69 
 
 
563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  27.7 
 
 
551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  28.44 
 
 
539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  29.57 
 
 
526 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  30.44 
 
 
568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 
566 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  28.72 
 
 
544 aa  167  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.6 
 
 
580 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>