291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0608 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 570 aa  1137    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  95.44 
 
 		 559 aa  1028    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  74.65 
 
 		 572 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  66.49 
 
 		 546 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  95.26 
 
 		 559 aa  1028    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  54.56 
 
 		 547 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  54.72 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  52.01 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  46.35 
 
 		 579 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  46.88 
 
 		 580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  46.29 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  42.19 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  46.03 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  39.69 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  39.3 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  37.95 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  37.26 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.52 
 
 		 551 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  34.08 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  35.2 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  33.06 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.12 
 
 		 538 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.17 
 
 		 541 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.93 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  27.72 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 539 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  30.25 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  32.58 
 
 		 527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.59 
 
 		 527 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  34.31 
 
 		 540 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  34.31 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.45 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  29.76 
 
 		 522 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  30.24 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 		 593 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.41 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  29.78 
 
 		 526 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  29.77 
 
 		 538 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  29.07 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.22 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.22 
 
 		 587 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  31.14 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  28.85 
 
 		 556 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.29 
 
 		 523 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  31.01 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 		 558 aa  177  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.79 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.04 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.54 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  30.82 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 544 aa  174  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  32.78 
 
 		 524 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 		 544 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 		 571 aa  174  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.38 
 
 		 576 aa  174  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  29.87 
 
 		 677 aa  173  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  29.21 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 603 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  28.25 
 
 		 566 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 542 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  31.29 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.23 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  28.63 
 
 		 529 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 		 588 aa  166  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  27.35 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.61 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  29.81 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 		 587 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  29.81 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  29.76 
 
 		 598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  29.76 
 
 		 598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  29.76 
 
 		 598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.32 
 
 		 504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  28.65 
 
 		 595 aa  163  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  29.44 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 		 579 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 		 579 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 		 584 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 		 543 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.62 
 
 		 594 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  28.98 
 
 		 552 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 598 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 598 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 598 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 598 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>