289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0242 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  71.76 
 
 		 568 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  71.94 
 
 		 563 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 557 aa  1113    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  71.23 
 
 		 563 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  49.91 
 
 		 545 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  45.31 
 
 		 553 aa  475  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  45.7 
 
 		 580 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  45.7 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  45.7 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  43.96 
 
 		 546 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  41.53 
 
 		 547 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  42.49 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  46.84 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  40.33 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  40.33 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  41.73 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  39.23 
 
 		 570 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 		 551 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.7 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  30.69 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 		 538 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 		 535 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  32.59 
 
 		 541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.58 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 		 538 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  32.2 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 539 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 525 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  32.64 
 
 		 566 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  30.18 
 
 		 542 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  31.25 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.16 
 
 		 600 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  28.69 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  30.66 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.78 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 509 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.48 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  30.59 
 
 		 523 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  29.2 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.72 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  33.49 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.05 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.26 
 
 		 592 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  28.67 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  31.22 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.58 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30 
 
 		 603 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.72 
 
 		 566 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 		 519 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 		 571 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  27.85 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.73 
 
 		 567 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  29.26 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  29.7 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  30.31 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.26 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  29.67 
 
 		 584 aa  170  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 		 587 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 		 588 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  28.21 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  29.27 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  35.26 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  29.72 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  27.68 
 
 		 598 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.69 
 
 		 587 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.19 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  27.65 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  28.69 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  29.65 
 
 		 594 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  28.08 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 		 548 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  28.92 
 
 		 611 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  28.92 
 
 		 611 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  28.8 
 
 		 611 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  34.32 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>