255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1312 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  80.43 
 
 		 543 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 509 aa  992    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  98.62 
 
 		 542 aa  979    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  49.53 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  47.03 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  50.79 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  46 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  34.54 
 
 		 552 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  35.8 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  34.54 
 
 		 540 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  35.19 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.2 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  35.36 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  34.26 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  33.65 
 
 		 525 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  34.87 
 
 		 532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  34.13 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 		 541 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  35.05 
 
 		 590 aa  192  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  31.73 
 
 		 546 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  30.86 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.68 
 
 		 539 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  31.05 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.41 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  32.02 
 
 		 538 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 		 533 aa  183  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  32.84 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  31.22 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  30.34 
 
 		 559 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  30.34 
 
 		 559 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 545 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  30.04 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  31.36 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  29.96 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  30.51 
 
 		 572 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 		 544 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.24 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  29.3 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.77 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 		 525 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 		 504 aa  171  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  31.58 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.49 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  29.98 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 580 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 563 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  36.06 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  27.94 
 
 		 544 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  31.08 
 
 		 579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  27.94 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  28.64 
 
 		 523 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  29.09 
 
 		 546 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 600 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30.64 
 
 		 552 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 		 561 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.61 
 
 		 603 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  31.86 
 
 		 597 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.17 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.68 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  27.56 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  34.63 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.46 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  30.7 
 
 		 529 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.57 
 
 		 587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  32 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 579 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  32.77 
 
 		 527 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 576 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  28.53 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.68 
 
 		 552 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  28.54 
 
 		 560 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.68 
 
 		 552 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  28.54 
 
 		 560 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.68 
 
 		 552 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.68 
 
 		 552 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.16 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  28.54 
 
 		 560 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  32.36 
 
 		 594 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  29.32 
 
 		 587 aa  143  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>