270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0941 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  80.7 
 
 		 541 aa  873    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  82.37 
 
 		 532 aa  847    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 539 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  82.93 
 
 		 532 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  81.43 
 
 		 540 aa  878    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  79.07 
 
 		 535 aa  819    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  82.56 
 
 		 538 aa  859    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  51.49 
 
 		 538 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  54.22 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  52.31 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  51.17 
 
 		 552 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  51.21 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  51.67 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  51.48 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  40.87 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  37.77 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  37.43 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  35.24 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  34.59 
 
 		 547 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.94 
 
 		 525 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.82 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  34.67 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.99 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 		 527 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  33.52 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  33.57 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.37 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  32.98 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 		 537 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.43 
 
 		 538 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  32.85 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  33.94 
 
 		 543 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  36.04 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  31.43 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  30.9 
 
 		 553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  32.02 
 
 		 593 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.53 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  230  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.9 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 544 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.89 
 
 		 611 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.89 
 
 		 611 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.74 
 
 		 579 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 		 587 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 		 559 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 		 559 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 579 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 579 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 603 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 597 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.23 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  29.7 
 
 		 590 aa  224  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 		 567 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.22 
 
 		 580 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 		 563 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 598 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.15 
 
 		 677 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  33.69 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  33.79 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 		 566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.3 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  33.05 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  29.71 
 
 		 563 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  32.61 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.79 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  30.71 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.8 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  30.14 
 
 		 552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31 
 
 		 565 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.2 
 
 		 570 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.2 
 
 		 570 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  30.2 
 
 		 570 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  30.55 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  36.27 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  34.66 
 
 		 530 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  34.26 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>