255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2972 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  80.22 
 
 		 543 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  98.62 
 
 		 509 aa  979    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 542 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  48.93 
 
 		 571 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  46.14 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  45.94 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  49.53 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.63 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  34.75 
 
 		 541 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.95 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  35.24 
 
 		 538 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  35.92 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  34.81 
 
 		 532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 		 540 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 		 540 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  33.39 
 
 		 539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 		 547 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  35.16 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.02 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  31.25 
 
 		 546 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.23 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  31.76 
 
 		 538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  31.77 
 
 		 519 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  32.21 
 
 		 547 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.41 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  30.78 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  31.71 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  30.55 
 
 		 557 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 		 544 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 572 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.26 
 
 		 539 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  29.06 
 
 		 563 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.16 
 
 		 504 aa  178  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.16 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  31.95 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  31.4 
 
 		 563 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  34.73 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.33 
 
 		 528 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  29.76 
 
 		 522 aa  173  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  31.72 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  31.32 
 
 		 570 aa  170  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  31.02 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  28.48 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 		 580 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 		 568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  30.51 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  27.86 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 600 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  27.86 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  30.66 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.51 
 
 		 567 aa  160  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.29 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  32.53 
 
 		 536 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.14 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30.04 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.89 
 
 		 595 aa  156  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  27.32 
 
 		 568 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.07 
 
 		 593 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.74 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.8 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 576 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.86 
 
 		 552 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.1 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 592 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  32.77 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  26.44 
 
 		 519 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 592 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.32 
 
 		 587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  31.58 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  29.32 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  32.43 
 
 		 594 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 		 568 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  28.53 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  30.74 
 
 		 568 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  29.61 
 
 		 563 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>