290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3458 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
547 aa  1103    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  37.73 
 
 
551 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  36.27 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  35.84 
 
 
540 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  36.49 
 
 
552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  38.96 
 
 
520 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  34.77 
 
 
538 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  34.53 
 
 
532 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 
535 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  34.59 
 
 
539 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 
532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 
539 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 
538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  34.26 
 
 
525 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.69 
 
 
540 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 
540 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  31.6 
 
 
551 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.32 
 
 
522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.85 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  29.74 
 
 
525 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.37 
 
 
528 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  28.54 
 
 
527 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 
572 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  29.52 
 
 
527 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  28.38 
 
 
530 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.69 
 
 
587 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.69 
 
 
536 aa  204  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.44 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.18 
 
 
539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 
553 aa  200  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.9 
 
 
580 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 
537 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 
519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.49 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.19 
 
 
677 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 
587 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.22 
 
 
587 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.22 
 
 
587 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.22 
 
 
587 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 
587 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.89 
 
 
539 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
598 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
598 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.77 
 
 
590 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
598 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.7 
 
 
504 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 
570 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  30.47 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30.02 
 
 
552 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  34.1 
 
 
559 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  34.1 
 
 
559 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 
560 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  33.02 
 
 
563 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  29.32 
 
 
580 aa  189  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  30.28 
 
 
567 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  30.11 
 
 
529 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 
567 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  28.15 
 
 
551 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.25 
 
 
563 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  28.6 
 
 
533 aa  186  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  29.5 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 
563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  28.87 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.18 
 
 
593 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
544 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  31.7 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.14 
 
 
595 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
544 aa  183  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  29.69 
 
 
547 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
542 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.86 
 
 
603 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  31.16 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  29.14 
 
 
594 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  29.96 
 
 
579 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.82 
 
 
576 aa  180  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  29.36 
 
 
594 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 
544 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.47 
 
 
561 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
598 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 
597 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 
552 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  31.69 
 
 
562 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  29.96 
 
 
569 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  35.1 
 
 
533 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  29.35 
 
 
519 aa  177  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
569 aa  177  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
570 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  29.69 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  27.8 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>