255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2649 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
526 aa  1048    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  49.34 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  50.19 
 
 
509 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  49.25 
 
 
543 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  42.34 
 
 
571 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  39.86 
 
 
558 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  40.46 
 
 
583 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
552 aa  239  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 
540 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 
538 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 
539 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 
538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 
541 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 
532 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 
541 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 
532 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  32.66 
 
 
551 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
539 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 
540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 
540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  33.48 
 
 
535 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.14 
 
 
525 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  29.96 
 
 
551 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 
559 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  30.76 
 
 
559 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.19 
 
 
527 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  29.87 
 
 
546 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  29.78 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  32.76 
 
 
547 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.88 
 
 
603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.19 
 
 
587 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.26 
 
 
528 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 
519 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  28.04 
 
 
539 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  31.36 
 
 
600 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.08 
 
 
539 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.34 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.17 
 
 
593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  29.89 
 
 
551 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 
538 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.2 
 
 
525 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.68 
 
 
504 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  33.08 
 
 
544 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.19 
 
 
523 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  28.03 
 
 
522 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  28.76 
 
 
527 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  27.5 
 
 
563 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  28.29 
 
 
547 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  29 
 
 
557 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 
587 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
572 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.02 
 
 
590 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.64 
 
 
567 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 
587 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 
677 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 
587 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 
587 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
598 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.37 
 
 
580 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
598 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
598 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  32.24 
 
 
530 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  27.58 
 
 
568 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.58 
 
 
533 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  31.34 
 
 
547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  29.75 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  30.87 
 
 
536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  27.06 
 
 
545 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  28.31 
 
 
563 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.73 
 
 
537 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  27.45 
 
 
544 aa  160  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 
592 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.88 
 
 
611 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.88 
 
 
611 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
579 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30.77 
 
 
552 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  30.06 
 
 
592 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  30.06 
 
 
592 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  27.02 
 
 
544 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  28.42 
 
 
597 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.51 
 
 
561 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  29.76 
 
 
529 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 
579 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  27.33 
 
 
520 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  28.19 
 
 
598 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.63 
 
 
552 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 
552 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 
552 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.71 
 
 
552 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 
595 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>