253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2947 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 571 aa  1136    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  48.93 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  49.47 
 
 		 543 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  49.53 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  45.9 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  44.8 
 
 		 583 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  43.24 
 
 		 526 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.77 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  33.69 
 
 		 541 aa  223  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  31.79 
 
 		 540 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  33.75 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  34.99 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  35.37 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 535 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  30.66 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  30.66 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.16 
 
 		 568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.79 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.13 
 
 		 525 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.12 
 
 		 519 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  29.46 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  31.03 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  28.14 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  31.42 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  30.89 
 
 		 551 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 527 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.54 
 
 		 533 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  31.63 
 
 		 538 aa  177  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.51 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  32.13 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.09 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.22 
 
 		 580 aa  173  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  30.56 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 		 590 aa  171  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  33.11 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  33.25 
 
 		 567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  29.91 
 
 		 572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  29.91 
 
 		 570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  30.36 
 
 		 579 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  32.21 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  29.74 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  27.87 
 
 		 546 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.11 
 
 		 595 aa  160  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  27.76 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 		 603 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 504 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  27.37 
 
 		 559 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  27.37 
 
 		 559 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  29.4 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  27.7 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  32.3 
 
 		 552 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  29.02 
 
 		 561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  30.22 
 
 		 544 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.9 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  30.12 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.54 
 
 		 587 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  27.49 
 
 		 529 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  29.87 
 
 		 594 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 567 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  29.5 
 
 		 548 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.17 
 
 		 566 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  30.14 
 
 		 567 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.7 
 
 		 611 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.09 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  29.38 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.09 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  25.54 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  29.88 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 		 598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.08 
 
 		 677 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 		 598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 		 598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  28.11 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>