More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0523 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  58.24 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 214 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 203 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.25 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 250 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.73 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.78 
 
 		 231 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 208 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.39 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.63 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  34.24 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  31.36 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>