More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2851 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  66.9 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  50 
 
 
151 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  46.15 
 
 
149 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  49.66 
 
 
150 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  47.65 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  46.15 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
145 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.61 
 
 
164 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  47.06 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
145 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.27 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  36.99 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.18 
 
 
180 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  43.75 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.24 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  41.27 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.47 
 
 
148 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
143 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.46 
 
 
152 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
143 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.42 
 
 
144 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.81 
 
 
290 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.41 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.1 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.41 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.25 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38 
 
 
187 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.49 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.97 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
147 aa  90.5  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.05 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.14 
 
 
142 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.65 
 
 
208 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  34.01 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.57 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.53 
 
 
287 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.23 
 
 
297 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.19 
 
 
307 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.17 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.33 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.08 
 
 
300 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.14 
 
 
138 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.78 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.01 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.13 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.21 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.9 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  35.71 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.9 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.77 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  35.53 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.61 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.97 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.2 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  32.65 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  31.08 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  29.55 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  35.26 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  37.5 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.91 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.67 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  35.26 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.88 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  37.5 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.89 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  34.67 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  29.25 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>