212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1123 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  100 
 
 		 488 aa  958    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  32.15 
 
 		 487 aa  238  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 474 aa  95.1  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  24.89 
 
 		 488 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 512 aa  86.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 422 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  20.76 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  27.07 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.09 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  32.62 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  21.33 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.6 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.02 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.24 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  25.48 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.15 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.51 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  22.15 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  25.29 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.99 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 539 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  26.32 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  27.5 
 
 		 518 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  24.23 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 489 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 507 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 501 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  32.19 
 
 		 508 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 515 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  26.33 
 
 		 416 aa  53.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 471 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 546 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.72 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  26.6 
 
 		 506 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>