More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2639 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 733 aa  1462    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  49.06 
 
 		 752 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  40.9 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  27.69 
 
 		 696 aa  242  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.24 
 
 		 829 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 720 aa  198  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  25.27 
 
 		 681 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  30.4 
 
 		 819 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 686 aa  173  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  24.96 
 
 		 763 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 733 aa  157  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.92 
 
 		 799 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  24.52 
 
 		 803 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  32.44 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  33.11 
 
 		 794 aa  150  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  24.23 
 
 		 751 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  22.73 
 
 		 780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  24.83 
 
 		 767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  34.53 
 
 		 833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  22.91 
 
 		 773 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  25.08 
 
 		 783 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.96 
 
 		 807 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  21.96 
 
 		 772 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  22.38 
 
 		 774 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.98 
 
 		 793 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 756 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  23.75 
 
 		 775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 803 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  23.22 
 
 		 775 aa  130  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 779 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 784 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  31.39 
 
 		 793 aa  127  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  31.15 
 
 		 776 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  29.25 
 
 		 801 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.96 
 
 		 747 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  30.64 
 
 		 751 aa  125  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.12 
 
 		 728 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  26.97 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  29.04 
 
 		 805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.54 
 
 		 750 aa  117  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  22.97 
 
 		 805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.44 
 
 		 635 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  21.46 
 
 		 904 aa  114  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  25.95 
 
 		 766 aa  114  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  27.21 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  27.07 
 
 		 736 aa  111  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.09 
 
 		 630 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  21.23 
 
 		 902 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.06 
 
 		 783 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  21.32 
 
 		 897 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  27.76 
 
 		 660 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.21 
 
 		 662 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  23.54 
 
 		 892 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  27.59 
 
 		 787 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  30.2 
 
 		 495 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  26.72 
 
 		 673 aa  107  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  26.41 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.64 
 
 		 740 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.45 
 
 		 804 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  22.98 
 
 		 717 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  21.57 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  21.57 
 
 		 750 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  21.57 
 
 		 757 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 810 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 738 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  22.64 
 
 		 744 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  25.86 
 
 		 584 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.4 
 
 		 696 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.46 
 
 		 636 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  26.43 
 
 		 655 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  24.94 
 
 		 784 aa  101  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  24.94 
 
 		 784 aa  101  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  25.33 
 
 		 781 aa  101  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  25.33 
 
 		 781 aa  101  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  23.33 
 
 		 634 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  26.25 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 753 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  27.88 
 
 		 640 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 655 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.84 
 
 		 640 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  23.13 
 
 		 632 aa  98.6  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  22.85 
 
 		 681 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  29.81 
 
 		 703 aa  98.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  24.54 
 
 		 812 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  28.38 
 
 		 496 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.82 
 
 		 698 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  28.85 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  23.09 
 
 		 771 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  28.97 
 
 		 653 aa  96.3  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.24 
 
 		 1421 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  22.94 
 
 		 777 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  27.06 
 
 		 803 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.82 
 
 		 698 aa  95.9  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  25.98 
 
 		 648 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>