More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4632 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  37.54 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  38.27 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  43.41 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.82 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.81 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 289 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.71 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.99 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.99 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.29 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.55 
 
 		 415 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.61 
 
 		 281 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.87 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.89 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.41 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.74 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  29.15 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.46 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.16 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.62 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.98 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.84 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.97 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  27.09 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  30.65 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.69 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.94 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.94 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.06 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  36.02 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  30.65 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.58 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  29.97 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  30.65 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  32.52 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.31 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 145 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.21 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  33.49 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.68 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.94 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.43 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.19 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.55 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  30.52 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  29.04 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.39 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30.1 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  31.98 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.36 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.48 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.54 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  25.71 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  26.1 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  34.69 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.35 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  32.79 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.21 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  28.28 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.08 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.86 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  29.22 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.81 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.46 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.57 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.24 
 
 		 145 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  26.95 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.92 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.13 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>