More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3437 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  68.7 
 
 
476 aa  659  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  100 
 
 
472 aa  942  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  66.67 
 
 
476 aa  641  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  68.49 
 
 
476 aa  656  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  77.54 
 
 
471 aa  752  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  63.73 
 
 
474 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  63.81 
 
 
388 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48342e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  49.17 
 
 
478 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  51.26 
 
 
457 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  48.52 
 
 
466 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  50.8 
 
 
458 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  48 
 
 
464 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  48.97 
 
 
476 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  47.3 
 
 
464 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  44.57 
 
 
502 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  47.02 
 
 
462 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.3 
 
 
479 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.12 
 
 
475 aa  339  6e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.84 
 
 
482 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.58 
 
 
485 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  41.86 
 
 
504 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.81 
 
 
502 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.72 
 
 
475 aa  332  7e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.54 
 
 
473 aa  332  7e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.3 
 
 
481 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  43.38 
 
 
485 aa  329  5e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  43.15 
 
 
484 aa  328  9e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.92 
 
 
506 aa  328  1e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.41 
 
 
476 aa  328  1e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.44 
 
 
505 aa  326  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.9 
 
 
461 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  40.52 
 
 
498 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.18 
 
 
477 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.06 
 
 
474 aa  313  3e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  42.67 
 
 
499 aa  313  4e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  41.2 
 
 
524 aa  313  5e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.79 
 
 
478 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.06 
 
 
474 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  41.03 
 
 
523 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40 
 
 
523 aa  308  1e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
480 aa  308  1e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.96 
 
 
473 aa  308  2e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.57 
 
 
491 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  42.25 
 
 
520 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.1 
 
 
469 aa  305  1e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.58 
 
 
500 aa  304  3e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  40.77 
 
 
523 aa  304  3e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  42.28 
 
 
482 aa  304  3e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41 
 
 
501 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.98 
 
 
489 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.91 
 
 
497 aa  302  1e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.5 
 
 
481 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.63 
 
 
464 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.22 
 
 
487 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.16 
 
 
467 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  41.89 
 
 
471 aa  299  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  40.25 
 
 
528 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.56 
 
 
501 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  46.94 
 
 
453 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.15082e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  44.04 
 
 
473 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  40.65 
 
 
516 aa  296  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.25 
 
 
473 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.65 
 
 
501 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  39.74 
 
 
499 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.31 
 
 
492 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.59 
 
 
483 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.34 
 
 
513 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.82 
 
 
483 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.34 
 
 
513 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  43.02 
 
 
515 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.72 
 
 
513 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  40.34 
 
 
524 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  39.52 
 
 
499 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 
467 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.53018e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.66 
 
 
483 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.51 
 
 
492 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.18 
 
 
477 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.37 
 
 
477 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 
526 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.91 
 
 
472 aa  293  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40 
 
 
479 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.22 
 
 
474 aa  292  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.17 
 
 
514 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  37.34 
 
 
503 aa  292  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  37.22 
 
 
498 aa  292  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  3.36016e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.42 
 
 
465 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.12 
 
 
460 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.48 
 
 
499 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.66 
 
 
385 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.43 
 
 
500 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.7 
 
 
500 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  40.32 
 
 
487 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  39.91 
 
 
490 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  50.65 
 
 
382 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  41.79 
 
 
498 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  41.26 
 
 
473 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  37.86 
 
 
473 aa  289  8e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  5.72701e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  39.74 
 
 
520 aa  289  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 
528 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  38.99 
 
 
455 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>