More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0512 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  100 
 
 		 506 aa  1048    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.44 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  33.64 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  33.52 
 
 		 379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  33.84 
 
 		 373 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.13 
 
 		 363 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.21 
 
 		 369 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  33.66 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.01 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.52 
 
 		 325 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.91 
 
 		 390 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  33.85 
 
 		 370 aa  143  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.03 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.94 
 
 		 435 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.64 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  31.51 
 
 		 368 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.39 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.25 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.57 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.56 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  31.35 
 
 		 377 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 388 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.03 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.03 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.02 
 
 		 477 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.4 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.52 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.67 
 
 		 400 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.94 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.96 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.43 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  30.97 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  30.97 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.57 
 
 		 409 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.69 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.64 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.36 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.85 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.36 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.94 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.1 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.38 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.04 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.51 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.46 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.11 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.3 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.43 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.32 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.91 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.17 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.17 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.94 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 393 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 386 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.85 
 
 		 365 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  25.34 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.45 
 
 		 656 aa  94  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.8 
 
 		 357 aa  93.6  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.23 
 
 		 378 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.85 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.32 
 
 		 391 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.59 
 
 		 353 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  26.69 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.53 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  30.42 
 
 		 438 aa  87.8  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.4 
 
 		 387 aa  87  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.71 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  24.77 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.04 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.34 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.15 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.45 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.89 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.7 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.74 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  23.92 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  28.21 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  26.64 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.46 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.84 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  25.6 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  23.63 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.56 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.15 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.33 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.48 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>