More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0592 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 456 aa  936    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.97 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.72 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.72 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 414 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  24.53 
 
 		 440 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.86 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.82 
 
 		 406 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  22.69 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.54 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.7 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  22.91 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.92 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.7 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.45 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.7 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.54 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.62 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.63 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>