More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3519 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  56.16 
 
 		 1528 aa  1477    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  56.73 
 
 		 1528 aa  1509    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  50.07 
 
 		 1489 aa  1276    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  42.5 
 
 		 1488 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  41.32 
 
 		 1485 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  56.73 
 
 		 1518 aa  1523    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  39.91 
 
 		 1197 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  42.42 
 
 		 1509 aa  694    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  55.95 
 
 		 1495 aa  1464    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  41.02 
 
 		 1259 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  100 
 
 		 1508 aa  3040    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  38.04 
 
 		 2144 aa  559  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1699 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.6 
 
 		 1614 aa  376  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  31.58 
 
 		 1517 aa  373  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1527 aa  369  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.52 
 
 		 1595 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.04 
 
 		 1576 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1611 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.3 
 
 		 1586 aa  363  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  31.2 
 
 		 1494 aa  358  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1494 aa  358  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1495 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.56 
 
 		 1547 aa  357  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  29.36 
 
 		 1673 aa  354  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.68 
 
 		 1572 aa  353  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  29.05 
 
 		 1679 aa  353  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1586 aa  352  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1487 aa  352  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1189 aa  351  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1551 aa  351  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  61.32 
 
 		 467 aa  349  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1520 aa  348  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.84 
 
 		 1609 aa  348  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1527 aa  346  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.01 
 
 		 1639 aa  343  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1550 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  338  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  338  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  338  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1381 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  337  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  29 
 
 		 1543 aa  336  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1554 aa  335  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  335  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1541 aa  335  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1552 aa  334  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  28.96 
 
 		 1475 aa  333  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  29.17 
 
 		 1437 aa  331  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.08 
 
 		 1560 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  28.96 
 
 		 1457 aa  329  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.81 
 
 		 1362 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  28.18 
 
 		 1447 aa  327  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1428 aa  326  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  28.11 
 
 		 1423 aa  324  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.68 
 
 		 1422 aa  324  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1505 aa  321  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  28.13 
 
 		 1568 aa  318  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1492 aa  316  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1531 aa  315  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.49 
 
 		 1421 aa  314  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.1 
 
 		 1434 aa  314  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1602 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1466 aa  311  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1600 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1400 aa  309  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1553 aa  308  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1409 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  27.01 
 
 		 1593 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  27.91 
 
 		 1539 aa  300  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.66 
 
 		 1348 aa  298  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  28.17 
 
 		 1616 aa  297  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.72 
 
 		 1385 aa  297  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  30.54 
 
 		 1428 aa  297  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  30.54 
 
 		 1579 aa  296  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.74 
 
 		 1573 aa  294  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  27.4 
 
 		 1539 aa  294  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.81 
 
 		 1379 aa  293  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1411 aa  292  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.55 
 
 		 1359 aa  290  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1386 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.27 
 
 		 924 aa  285  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1418 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.44 
 
 		 1446 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  29.31 
 
 		 931 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1419 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1390 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1402 aa  267  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1565 aa  266  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1565 aa  266  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  26.64 
 
 		 1150 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  26.64 
 
 		 1150 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.93 
 
 		 1429 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1150 aa  264  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  28.53 
 
 		 1149 aa  264  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.04 
 
 		 1981 aa  262  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1368 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1410 aa  258  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 867 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  26.53 
 
 		 1150 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>