11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5394 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  932    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  56.28 
 
 
1489 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  62.46 
 
 
1528 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  58.98 
 
 
1508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  61.51 
 
 
1518 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  58.31 
 
 
1495 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  60.65 
 
 
1528 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8668  hypothetical protein  29.81 
 
 
765 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5135  hypothetical protein  37.35 
 
 
754 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372237  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5150  hypothetical protein  25.21 
 
 
634 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0397106  normal  0.0961186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4620  hypothetical protein  26.47 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.456962  hitchhiker  0.00062706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>