9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8668 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8668  hypothetical protein  100 
 
 
765 aa  1555    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5135  hypothetical protein  33.2 
 
 
754 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372237  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  32.69 
 
 
1489 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  31.73 
 
 
1495 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  31.73 
 
 
1528 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  30.97 
 
 
1508 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.09 
 
 
1518 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  29.81 
 
 
467 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.32 
 
 
1528 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>