9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5135 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5135  hypothetical protein  100 
 
 
754 aa  1507    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372237  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8668  hypothetical protein  33.2 
 
 
765 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  37.35 
 
 
467 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  40.32 
 
 
1495 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  31.11 
 
 
1489 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  38.71 
 
 
1528 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  38.71 
 
 
1508 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  38.71 
 
 
1518 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  36.84 
 
 
1528 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>