9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4620 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4620  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1029    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.456962  hitchhiker  0.00062706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.19 
 
 		 1508 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.7 
 
 		 1528 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.86 
 
 		 1518 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.44 
 
 		 1489 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.86 
 
 		 1528 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4004  hypothetical protein  43.86 
 
 		 551 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1495 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  27.38 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>