More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0220 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  47.87 
 
 		 821 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.65 
 
 		 790 aa  764    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  47.87 
 
 		 776 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  47.98 
 
 		 821 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  47.87 
 
 		 776 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  47.85 
 
 		 776 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 779 aa  1585    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  56.44 
 
 		 781 aa  845    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  48.95 
 
 		 790 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  47.87 
 
 		 776 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  48.48 
 
 		 797 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  88.99 
 
 		 780 aa  1412    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  88.99 
 
 		 780 aa  1412    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 776 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.22 
 
 		 1143 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.7 
 
 		 1116 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 974 aa  306  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31 
 
 		 1144 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 717 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 789 aa  297  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 633 aa  295  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 717 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.07 
 
 		 585 aa  292  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.2 
 
 		 1106 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 		 529 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 754 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 619 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 		 627 aa  273  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1106 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1714 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 715 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.59 
 
 		 723 aa  271  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 		 699 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 732 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 		 589 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 968 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 754 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 828 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 824 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 828 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 828 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 713 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 822 aa  260  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 789 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 708 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.42 
 
 		 667 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 		 589 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 647 aa  250  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 734 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.23 
 
 		 921 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 626 aa  248  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 833 aa  248  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.07 
 
 		 1221 aa  247  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 833 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.25 
 
 		 937 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 796 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.29 
 
 		 739 aa  240  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 693 aa  235  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.72 
 
 		 553 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  29.12 
 
 		 1415 aa  230  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1085 aa  221  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.39 
 
 		 708 aa  221  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.83 
 
 		 739 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  30.51 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.72 
 
 		 739 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 718 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 633 aa  206  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.3 
 
 		 596 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.21 
 
 		 740 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 808 aa  185  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 739 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.61 
 
 		 816 aa  184  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 733 aa  178  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 654 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 811 aa  177  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 672 aa  174  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  27.74 
 
 		 568 aa  174  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.03 
 
 		 742 aa  173  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 4489 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 3035 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 667 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 3560 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1094 aa  171  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 700 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 909 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 618 aa  168  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 750 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.31 
 
 		 633 aa  161  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 740 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  28.77 
 
 		 560 aa  157  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  29.52 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 632 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 616 aa  154  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  31.33 
 
 		 630 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>