More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0866 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  68.15 
 
 
756 aa  939    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  68.15 
 
 
756 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  68.74 
 
 
756 aa  947    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  68.59 
 
 
820 aa  947    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  92.1 
 
 
696 aa  1283    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  68.49 
 
 
822 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  68.15 
 
 
756 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  68.59 
 
 
756 aa  947    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
696 aa  1395    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  96.76 
 
 
701 aa  1324    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
696 aa  1395    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 
707 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  68.15 
 
 
756 aa  939    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 
707 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  47.82 
 
 
705 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  45.36 
 
 
704 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  45.32 
 
 
776 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  44.05 
 
 
689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  46.04 
 
 
755 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  44.58 
 
 
758 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.67 
 
 
708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  43.04 
 
 
718 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  44.34 
 
 
738 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  45.35 
 
 
705 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.63 
 
 
721 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  42.63 
 
 
720 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 
708 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.99 
 
 
739 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 
728 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 
742 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  44.61 
 
 
727 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.62 
 
 
770 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 
747 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  43.83 
 
 
747 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  43.52 
 
 
747 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  41.99 
 
 
723 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  42.98 
 
 
746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 
690 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.45 
 
 
703 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 
712 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
720 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 
703 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 
716 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  32.91 
 
 
730 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  32.62 
 
 
730 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  31.98 
 
 
784 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 
728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
749 aa  308  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
710 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 
717 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
724 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
721 aa  275  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
726 aa  273  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 
779 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 
735 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.84 
 
 
737 aa  243  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.59 
 
 
797 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.35 
 
 
813 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 
399 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.17 
 
 
601 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
797 aa  172  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 
527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 
707 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.29 
 
 
833 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
789 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.9 
 
 
718 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 
829 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 
806 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 
770 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  24.6 
 
 
711 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 
863 aa  156  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 
733 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 
701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 
710 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 
850 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
701 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 
713 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
701 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 
705 aa  152  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
723 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 
699 aa  151  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
710 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 
701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 
831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
778 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  24.9 
 
 
729 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  26.71 
 
 
747 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  26.35 
 
 
747 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 
859 aa  147  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  26.71 
 
 
747 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 
757 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 
700 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 
709 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  25.82 
 
 
747 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  25.76 
 
 
747 aa  144  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 
701 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 
817 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 
730 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>