152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0966 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 341 aa  703    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  36.95 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  36.92 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  35.56 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  36.73 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  34.65 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  32.92 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  33.85 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  34.95 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  30.51 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  29.97 
 
 		 383 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  31.75 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  29.24 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  29.39 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  26.77 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  28.96 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  27.09 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  26.39 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.11 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  25.37 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  27.43 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  27.78 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  25.95 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  24.76 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23.19 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  23.89 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.17 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  24.48 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.28 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.51 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.99 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  24.41 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  23.72 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  25.81 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  24.63 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  24.89 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  23 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  27.41 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.75 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.25 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  22.63 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.92 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  23.25 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  29.33 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  26.67 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  27.8 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  32 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  22.56 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  28.91 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.79 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  24.44 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.01 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  24.74 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.12 
 
 		 454 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.29 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  25.95 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.23 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.57 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.81 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.04 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  24.08 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  23.69 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  23.69 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  25.98 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  24.39 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  20.56 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  28.91 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.94 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.54 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  24.79 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  23.34 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  22.51 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  23 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  21.75 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>