More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1007 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
194 aa  396  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  96.91 
 
 
194 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  87.63 
 
 
194 aa  351  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  85.57 
 
 
194 aa  343  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
188 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  21.4 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
290 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  23.29 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  22.31 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.82 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
196 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
241 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
196 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.27 
 
 
181 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  40.68 
 
 
205 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  25.89 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  19.35 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  17.93 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
240 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
237 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
376 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 
241 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
204 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
220 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 
202 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>