137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0944 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  100 
 
 
824 aa  1701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  30.6 
 
 
679 aa  157  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  33.33 
 
 
578 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  27.66 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  31.87 
 
 
579 aa  140  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.09 
 
 
484 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  30.77 
 
 
579 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  28.91 
 
 
552 aa  134  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.35 
 
 
562 aa  134  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  28.91 
 
 
552 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  26.34 
 
 
782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.66 
 
 
510 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  28.16 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  27.92 
 
 
505 aa  103  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  24.85 
 
 
1020 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.48 
 
 
429 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  22.92 
 
 
666 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  22.73 
 
 
892 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  27.11 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  25.28 
 
 
727 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.1 
 
 
683 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  26.29 
 
 
701 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  26.42 
 
 
723 aa  64.3  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  27.67 
 
 
530 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.59 
 
 
684 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  28.81 
 
 
768 aa  60.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  22.63 
 
 
726 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  38.04 
 
 
568 aa  58.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  23.85 
 
 
583 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  25.83 
 
 
708 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  25.83 
 
 
708 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  25.83 
 
 
708 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.08 
 
 
816 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.55 
 
 
718 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  18.68 
 
 
739 aa  55.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  24.2 
 
 
684 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  28.03 
 
 
733 aa  55.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.3 
 
 
535 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  21.45 
 
 
700 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  35.16 
 
 
548 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  27.78 
 
 
657 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  24.77 
 
 
709 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  35.96 
 
 
553 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  23.08 
 
 
729 aa  52.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  21.89 
 
 
750 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.51 
 
 
735 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  24.69 
 
 
728 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  27.41 
 
 
699 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  24.54 
 
 
713 aa  51.6  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  38.89 
 
 
1150 aa  51.2  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.77 
 
 
699 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36.67 
 
 
1057 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.38 
 
 
445 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  21.21 
 
 
1172 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  24.69 
 
 
708 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  24.69 
 
 
708 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  41.82 
 
 
1094 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  29.37 
 
 
669 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  34.94 
 
 
574 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.58 
 
 
2000 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  39.53 
 
 
517 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  21.95 
 
 
713 aa  49.3  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  24.41 
 
 
427 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  22.96 
 
 
558 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  23.93 
 
 
774 aa  48.5  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.96 
 
 
1916 aa  48.9  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  25.13 
 
 
747 aa  48.9  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  47.83 
 
 
1361 aa  48.9  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  23.68 
 
 
716 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  24.1 
 
 
743 aa  48.5  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.4 
 
 
707 aa  48.5  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.13 
 
 
453 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.82 
 
 
1565 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.86 
 
 
700 aa  48.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  37.35 
 
 
861 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.05 
 
 
792 aa  47.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  22.27 
 
 
718 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  31.18 
 
 
677 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  22.46 
 
 
729 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  20.99 
 
 
734 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  24.64 
 
 
709 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  26.28 
 
 
707 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  24.75 
 
 
701 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  25.82 
 
 
446 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  40.68 
 
 
2066 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  37.68 
 
 
623 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  23.74 
 
 
433 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.69 
 
 
706 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  43.59 
 
 
658 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  22.54 
 
 
724 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.16 
 
 
688 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  24.09 
 
 
714 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  23.39 
 
 
747 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  26.39 
 
 
1556 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  30.97 
 
 
820 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.06 
 
 
675 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.59 
 
 
669 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.74 
 
 
3197 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.43 
 
 
597 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  32.14 
 
 
2031 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>