239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1366 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  43.01 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 198 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  29.45 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  35.16 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>