115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0008 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  33.88 
 
 
716 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  35.16 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  29.76 
 
 
329 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  29.64 
 
 
349 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.96 
 
 
647 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  29.03 
 
 
644 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  29.71 
 
 
802 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  31.91 
 
 
349 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  33.94 
 
 
660 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  32.29 
 
 
715 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  31.65 
 
 
641 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  26.19 
 
 
807 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  28.67 
 
 
652 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  26.46 
 
 
697 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  29.71 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  22.52 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.29 
 
 
684 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  23.58 
 
 
678 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  26.03 
 
 
679 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  27.21 
 
 
601 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.39 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  22.77 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  23.45 
 
 
450 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  26.01 
 
 
625 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  26.12 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  29.31 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  30.09 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.36 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.33 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.08 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  24.52 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  29.41 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  25.27 
 
 
590 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.72 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.19 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  22.09 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.02 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  23.49 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.58 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.33 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  24.44 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  24.37 
 
 
326 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.17 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.17 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.17 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  23.6 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.54 
 
 
325 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.18 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  27.64 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  24.74 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  27.78 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.33 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.87 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  26.61 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.37 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.13 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  27.78 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25.68 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.95 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  26.09 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.83 
 
 
660 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  27.54 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  28.87 
 
 
323 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.61 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25.62 
 
 
324 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  20.91 
 
 
337 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  23.74 
 
 
325 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  24.79 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.07 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  23.97 
 
 
604 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.9 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  29.73 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.93 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.02 
 
 
322 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  26.27 
 
 
558 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  19.44 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  23.62 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.14 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  24.51 
 
 
615 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  23.93 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  26.27 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  25.19 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.68 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  24.83 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  21.74 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.43 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  23.57 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  27.45 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  27.5 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.55 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  22.52 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  19.68 
 
 
581 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  28.37 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  23.01 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  22.43 
 
 
325 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  26.5 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  22.43 
 
 
325 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>