More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004048 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0538  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  85.56 
 
 
457 aa  725    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1517  C4-dicarboxylate transport protein  90.51 
 
 
453 aa  795    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0710  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  86 
 
 
457 aa  726    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004048  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system large permease component  100 
 
 
453 aa  885    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1811  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  74.67 
 
 
458 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0620  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  58.98 
 
 
465 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.447582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136  C4-dicarboxylate transport protein  55.77 
 
 
465 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2808  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.86 
 
 
465 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1426  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.86 
 
 
465 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0870097  normal  0.820962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1414  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.08 
 
 
465 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.70486  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1550  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.86 
 
 
465 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0883981  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2826  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.86 
 
 
465 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.922037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2910  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.89 
 
 
465 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2951  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.86 
 
 
465 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0943549  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1361  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.64 
 
 
465 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.605043  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2717  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.02 
 
 
465 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0391497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68290  C4-dicarboxylate transporter  61.11 
 
 
427 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2211  C4-dicarboxylate transport protein  58.39 
 
 
466 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2502  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  55.99 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5908  C4-dicarboxylate transporter  61.34 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.75076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1444  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.89 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.538957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.46 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3052  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  60.65 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669713  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3327  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  56.67 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868747  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  59.03 
 
 
426 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03630  TRAP dicarboxylate transporter, large integral membrane subunit; DctM  58.84 
 
 
427 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00244507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4628  C4-dicarboxylate transporter  61.03 
 
 
427 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52810  C4-dicarboxylate transporter  61.27 
 
 
427 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1822  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  50.68 
 
 
460 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00945671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2137  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.71 
 
 
428 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0123809  normal  0.887659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2991  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  48.99 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0932755  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3396  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.21 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2121  C4-dicarboxylate transport system permease, large subunit  48.32 
 
 
427 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.306053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1574  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  47.95 
 
 
459 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0331  trap dicarboxylate transporter- dctm subunit  48.34 
 
 
430 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  48.41 
 
 
459 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1481  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  48.99 
 
 
427 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4175  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  48.76 
 
 
427 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2661  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  44.87 
 
 
462 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2262  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.19 
 
 
441 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2115  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  46.84 
 
 
441 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3266  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.52 
 
 
427 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3483  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  49.21 
 
 
427 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3676  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.89 
 
 
427 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6041  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component (dctM subunit)  47.31 
 
 
441 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145661  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  50.47 
 
 
427 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000085422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0912  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  46.3 
 
 
441 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2571  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.52 
 
 
441 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.870036  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0241  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  45.1 
 
 
441 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300698  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0917  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  64.52 
 
 
537 aa  362  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0829086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5946  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.26 
 
 
441 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133391  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4120  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  43.57 
 
 
440 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141301  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3232  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  45.75 
 
 
441 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.941655  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5226  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  45.97 
 
 
441 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1931  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.05 
 
 
640 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0543  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.58 
 
 
426 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  40.09 
 
 
635 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3956  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.81 
 
 
425 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0342  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.96 
 
 
430 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.51 
 
 
628 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.2 
 
 
634 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1069  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.06 
 
 
426 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0369  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.69 
 
 
624 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3874  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.22 
 
 
428 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3456  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.81 
 
 
426 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1939  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.77 
 
 
425 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0392462  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02560  hypothetical protein  38.66 
 
 
426 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1742  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.77 
 
 
425 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.16 
 
 
425 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0515873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.5 
 
 
424 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1869  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  41.4 
 
 
425 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0850712  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0898  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.14 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.23627  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2401  TRAP transporter, DctM subunit  37.67 
 
 
430 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000128119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1049  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.92 
 
 
426 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0270  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.95 
 
 
425 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1722  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.96 
 
 
424 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2498  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.67 
 
 
430 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.768752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1112  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.33 
 
 
427 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4093  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.59 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0385  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.57 
 
 
430 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2978  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.62 
 
 
426 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1687  TRAP transporter subunit DctM  37.89 
 
 
429 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00011098  normal  0.0463686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4632  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.08 
 
 
624 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0090  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.89 
 
 
446 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1185  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.7 
 
 
426 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0078152  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4244  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.92 
 
 
426 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.525518  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3542  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.59 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3706  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.86 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1589  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.17 
 
 
633 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000238856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1167  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.39 
 
 
426 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0119515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0448  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  39.73 
 
 
425 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1201  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.39 
 
 
426 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007912  Sde_0934  ribosomal protein L16  36.55 
 
 
435 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113697  hitchhiker  0.00733606 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0045  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.69 
 
 
424 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009439  Pmen_3303  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.59 
 
 
426 aa  255  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.99332 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3116  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.78 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  hitchhiker  0.000905066 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2291  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.24 
 
 
421 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.5258 
 
 
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NC_008688  Pden_5064  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.03 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.556964  normal 
 
 
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NC_007778  RPB_3580  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  35.43 
 
 
436 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.263303  normal  0.28531 
 
 
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NC_009253  Dred_0409  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.71 
 
 
427 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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