More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5946 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2991  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  76.87 
 
 
427 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0932755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5946  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  100 
 
 
441 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0912  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  80.91 
 
 
441 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1822  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  74.43 
 
 
460 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00945671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1481  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  76.19 
 
 
427 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4175  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  75.96 
 
 
427 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3232  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  81.18 
 
 
441 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.941655  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3396  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  76.42 
 
 
427 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2262  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  80.95 
 
 
441 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2115  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  81.41 
 
 
441 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0241  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  79.55 
 
 
441 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300698  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1574  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  74.25 
 
 
459 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2571  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  80.68 
 
 
441 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.870036  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5226  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  95.46 
 
 
441 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6041  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component (dctM subunit)  80.84 
 
 
441 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145661  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  74.71 
 
 
459 aa  631  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3266  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  74.6 
 
 
427 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341254  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3676  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  75.74 
 
 
427 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4120  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  69.93 
 
 
440 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141301  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2661  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  68.86 
 
 
462 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3483  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  72.79 
 
 
427 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68290  C4-dicarboxylate transporter  53.4 
 
 
427 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5908  C4-dicarboxylate transporter  52.93 
 
 
427 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.75076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2121  C4-dicarboxylate transport system permease, large subunit  50.46 
 
 
427 aa  418  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.306053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0331  trap dicarboxylate transporter- dctm subunit  51.36 
 
 
430 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3327  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  55.48 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868747  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  53.85 
 
 
426 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136  C4-dicarboxylate transport protein  49.05 
 
 
465 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3052  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  53.3 
 
 
427 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669713  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03630  TRAP dicarboxylate transporter, large integral membrane subunit; DctM  53.3 
 
 
427 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00244507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2502  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.26 
 
 
465 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0620  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  48.11 
 
 
465 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.447582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4628  C4-dicarboxylate transporter  55.66 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52810  C4-dicarboxylate transporter  55.66 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2808  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.26 
 
 
465 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2951  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.26 
 
 
465 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0943549  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1550  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.26 
 
 
465 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0883981  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1426  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.15 
 
 
465 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0870097  normal  0.820962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2826  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.26 
 
 
465 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.922037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1414  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.15 
 
 
465 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.70486  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1517  C4-dicarboxylate transport protein  47.15 
 
 
453 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004048  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system large permease component  46.26 
 
 
453 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1361  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.15 
 
 
465 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.605043  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2137  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  51.18 
 
 
428 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0123809  normal  0.887659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2910  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.04 
 
 
465 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2717  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  47.98 
 
 
465 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0391497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1444  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  49.47 
 
 
465 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.538957  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1811  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  45.91 
 
 
458 aa  358  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  48.62 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2211  C4-dicarboxylate transport protein  49.26 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0538  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  44.76 
 
 
457 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  47.14 
 
 
427 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000085422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0710  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  44.76 
 
 
457 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3679  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  73.62 
 
 
540 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550122  normal  0.176797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0543  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.37 
 
 
426 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1931  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.55 
 
 
640 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1069  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.23 
 
 
426 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0342  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.82 
 
 
430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3874  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.41 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2498  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.5 
 
 
430 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.768752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2401  TRAP transporter, DctM subunit  37.5 
 
 
430 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000128119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1687  TRAP transporter subunit DctM  37.5 
 
 
429 aa  309  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00011098  normal  0.0463686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3456  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.53 
 
 
426 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.32 
 
 
628 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0369  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.4 
 
 
624 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1722  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.82 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0385  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.9 
 
 
430 aa  302  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  40.93 
 
 
635 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1112  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.95 
 
 
427 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.91 
 
 
634 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1185  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.47 
 
 
426 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0078152  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4244  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.93 
 
 
426 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.525518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1201  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.7 
 
 
426 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1167  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.01 
 
 
426 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0119515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1939  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.1 
 
 
425 aa  289  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0392462  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1742  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.1 
 
 
425 aa  289  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3019  C4-dicarboxylate transport system, large permease subunit  38.57 
 
 
427 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0108982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0898  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.78 
 
 
426 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.23627  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3303  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.7 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.99332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5945  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.58 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3956  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.62 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1049  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.32 
 
 
426 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29892  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02560  hypothetical protein  36.17 
 
 
426 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0045  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.48 
 
 
424 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1832  sialic acid TRAP transporter permease protein  35.98 
 
 
446 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.670907  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3116  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.04 
 
 
422 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  hitchhiker  0.000905066 
 
 
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NC_013173  Dbac_2445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.73 
 
 
424 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0270  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.74 
 
 
425 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013173  Dbac_1589  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.24 
 
 
633 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000238856  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1074  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.76 
 
 
426 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0090  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.19 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012791  Vapar_3297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.15 
 
 
425 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0515873  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2291  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.17 
 
 
421 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.5258 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4632  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.88 
 
 
624 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248929  n/a   
 
 
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NC_007488  RSP_4014  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit DctM  36.57 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1869  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.14 
 
 
425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0850712  normal  0.204249 
 
 
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NC_007908  Rfer_0448  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.61 
 
 
425 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2978  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  36.38 
 
 
426 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735249  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0484  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  35.42 
 
 
426 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.424428  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0130  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component (dctM subunit)  34.7 
 
 
430 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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