More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0727 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0727  type II secretion system protein E  100 
 
 		 392 aa  775    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.61 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  27.44 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  32.18 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  33.33 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  29.77 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  26.45 
 
 		 542 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0173  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.579319  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  33.91 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  26.25 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  30.41 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1406  type II secretion system protein E  37.12 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  27.61 
 
 		 556 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.59 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  29.24 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2200  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  30 
 
 		 640 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  28.08 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 551 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  30.65 
 
 		 462 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  30.65 
 
 		 462 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  30.67 
 
 		 565 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26.02 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 577 aa  53.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  29.17 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  29.49 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5468  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0233856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  25.58 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  29.94 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  27.2 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  29.46 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  28.92 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0580  twitching motility protein  24.71 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  23.81 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  30.65 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  26.21 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 628 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  26.63 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  28.08 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  26.7 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 611 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  32.14 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  24.33 
 
 		 559 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  32.14 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 566 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  26.47 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  31.16 
 
 		 567 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 343 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  32.14 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  24.55 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  26.7 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 513 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  33.33 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  28.9 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  33.33 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 611 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  33.33 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  28.57 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 611 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 611 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 549 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  25.42 
 
 		 604 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  26.14 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  33.33 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  33.62 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  33.62 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  25.6 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  28.24 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  31.9 
 
 		 594 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  33.62 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  25.66 
 
 		 557 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  33.62 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  33.62 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  31.5 
 
 		 560 aa  49.7  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  26.47 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  28.57 
 
 		 563 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  21.79 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  26.47 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 682 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  24.07 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 591 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  29.45 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  26.79 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>