More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1329 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  100 
 
 		 342 aa  694    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  66.96 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.241792 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  65.4 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  65.01 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  25.68 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  22.89 
 
 		 492 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  29.12 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  22.74 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  29.12 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  29.94 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  26.32 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  27.55 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  23.44 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  29.22 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  26.27 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  25.57 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  24.54 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  21.18 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  23.67 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  25.48 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  27.67 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  26.91 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.74 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  25.59 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  25 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  29.33 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  25.98 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  30.48 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  23.03 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  32.39 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  24.25 
 
 		 481 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 513 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.84 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  29.79 
 
 		 591 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  29.01 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  29.01 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.83 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  24.91 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  26.61 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  26.94 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  24.25 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  31.03 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  24.9 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  26.94 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.31 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  26.79 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  31.72 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  27.31 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  23.36 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  27.31 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  26.82 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  26.59 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  26.59 
 
 		 478 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.56 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.94 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  30 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 767 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  24.06 
 
 		 445 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  30.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  29.41 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.55 
 
 		 594 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  28.96 
 
 		 474 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  34.03 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  22.71 
 
 		 628 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 611 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 611 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  26.9 
 
 		 638 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  27.78 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  27.2 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0043  twitching motility protein  33.33 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  28.97 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  26.54 
 
 		 459 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 564 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  28.49 
 
 		 611 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  25.99 
 
 		 570 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  28.4 
 
 		 483 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 544 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  28.39 
 
 		 344 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  31.39 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  24.9 
 
 		 449 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  28.16 
 
 		 513 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  26.32 
 
 		 634 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 557 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  24.91 
 
 		 433 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  26.95 
 
 		 481 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  29.68 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.31 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.31 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>