More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1054 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  100 
 
 		 342 aa  695    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  65.4 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  56.89 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.241792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  58.94 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 492 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  27.43 
 
 		 492 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  29.48 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  23.72 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  25.78 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  24.41 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  24.81 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  23.72 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  23.87 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  25.39 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  24.53 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  24.38 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  25.17 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  22.73 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  24.47 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  24.76 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 654 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  23.58 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  23.6 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  23.1 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  22.81 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 624 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  27.24 
 
 		 609 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  25.1 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  23.38 
 
 		 445 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  27.75 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  24.46 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  28.93 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  27.75 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  22.88 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  24.46 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  24.46 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  25 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  24.46 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  24.46 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  24.46 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  28.76 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  24.1 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  25.17 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  25 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  24.24 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  23.17 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  23.61 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 991 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  23.17 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  26.45 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  25.61 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  26.38 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  22.62 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  26.64 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  23.17 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  24.03 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  24.91 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  27.2 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  24.44 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  23.67 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  24.91 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  23.21 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  25.76 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  23.43 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  24.32 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  22.48 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  23.31 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  27.71 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  24.91 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  23.38 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  25.59 
 
 		 513 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  22.18 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  23.43 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  24.53 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 1319 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  26.14 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  26.42 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  21.55 
 
 		 618 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  23.62 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  23.67 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  24.9 
 
 		 638 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  24.26 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  25 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  25.28 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  22.76 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  24.12 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  23.3 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  27.74 
 
 		 1255 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  23.3 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  23.3 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  23.94 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>