More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1032 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  100 
 
 
551 aa  1114    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  64.04 
 
 
542 aa  693    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  66.99 
 
 
591 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  65.79 
 
 
556 aa  714    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  48.31 
 
 
797 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  48.1 
 
 
549 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  47.07 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  47.5 
 
 
628 aa  488  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  46.51 
 
 
640 aa  478  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  45.71 
 
 
558 aa  475  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  47.58 
 
 
609 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  43.83 
 
 
654 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  43 
 
 
682 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  44.47 
 
 
791 aa  445  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
749 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  44.22 
 
 
547 aa  439  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
831 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
847 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
1319 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  51.42 
 
 
1255 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  42.46 
 
 
692 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
1335 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  40.81 
 
 
770 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.14 
 
 
583 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
991 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
722 aa  362  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.65 
 
 
545 aa  360  4e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  43.58 
 
 
612 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
510 aa  325  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.74 
 
 
519 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  35.91 
 
 
671 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.68 
 
 
617 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  39.28 
 
 
604 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
620 aa  293  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  39.74 
 
 
618 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
622 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.26 
 
 
549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
489 aa  272  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
492 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
610 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
559 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
547 aa  266  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
557 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  35.82 
 
 
557 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  35.44 
 
 
557 aa  257  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  33.94 
 
 
557 aa  257  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  37 
 
 
513 aa  251  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  33.71 
 
 
512 aa  248  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
543 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  31.51 
 
 
546 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
577 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
546 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  31.87 
 
 
546 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
572 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.34 
 
 
552 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
548 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
544 aa  233  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
552 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
553 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
553 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
553 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
553 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  37.38 
 
 
311 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.16 
 
 
515 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  27.16 
 
 
476 aa  191  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  28.44 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.58 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  33.16 
 
 
445 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  34.52 
 
 
468 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  33.98 
 
 
438 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
474 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  32.25 
 
 
639 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36.78 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  37.4 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  37.4 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  37.4 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
440 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  32.17 
 
 
470 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
465 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  37.02 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  31.81 
 
 
677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.27 
 
 
521 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.15 
 
 
478 aa  163  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.99 
 
 
449 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
440 aa  163  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.64 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  35.56 
 
 
469 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  34.35 
 
 
491 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
469 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
477 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
412 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
450 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
455 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.23 
 
 
438 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
450 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
450 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  36.26 
 
 
447 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>