More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2133 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  100 
 
 		 343 aa  701    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  65.01 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  59.77 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.241792 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  58.94 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  28.35 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  28.08 
 
 		 491 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  27.95 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  26.62 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  26.36 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  27.24 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  27.27 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  25.91 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  29.92 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  30.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  30.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  25.71 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  27.76 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  25.4 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  26.27 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  25 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  26.21 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  25.79 
 
 		 638 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  26.75 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  29.39 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  24.52 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  25.1 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  25.1 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  27.24 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  25.79 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0126  type II secretion system protein E  28.39 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721545  normal  0.429419 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  24.9 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  26.56 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  26.09 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.88 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  27.45 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  26.64 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  25.65 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  28.51 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  26.04 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  24.9 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  22.78 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  24.81 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.13 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  28.17 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  24.9 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  24.9 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  22.97 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  27.69 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  27.84 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  33.06 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  21.43 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  24.21 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  26.54 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  24.74 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  27.69 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  25.4 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  23.05 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  26.94 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  25.29 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  23.57 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  24.62 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  27.5 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  27.84 
 
 		 454 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  27.84 
 
 		 454 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 456 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  27.84 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  24.81 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  26.15 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  27.24 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  23.51 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  24.02 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  27.76 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.15 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  25.2 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  27.06 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  32.31 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  25.59 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  25.09 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  24.08 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  24.9 
 
 		 594 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>