More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0608 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  100 
 
 		 423 aa  855    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  73.1 
 
 		 423 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  64.92 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  54.07 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  54.07 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  54.07 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  53.35 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  53.35 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  57.18 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  53.35 
 
 		 523 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  53.59 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  53.35 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  53.35 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  53.11 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  52.66 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  52.66 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  54.15 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  51.91 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  51.31 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  53.98 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  55.58 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  51.47 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  52.15 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  50.74 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  49.41 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  50.98 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 490 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  49.4 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  50.73 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  48.93 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  49.49 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  50.73 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  50.12 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  51.02 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 488 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 624 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  53.81 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  49.4 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  49.27 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  49.02 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50.25 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  48.31 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  51.02 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  50.25 
 
 		 521 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  48.45 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  50.97 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  49 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  52.76 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  48.47 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  48.48 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  47.97 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.7 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  52.72 
 
 		 572 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.38 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  50 
 
 		 569 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.38 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  54.57 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  49.22 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  47.76 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  47.14 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  49.76 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  48.53 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.38 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  48.89 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  47.39 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  51.9 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  56.45 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.87 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  47.15 
 
 		 456 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  49.52 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.83 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  52.29 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  50.86 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  51.25 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  53.04 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  49.25 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  47.72 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  48.97 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.06 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  48.99 
 
 		 638 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  47.25 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  46.57 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.51 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  46.81 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  50.67 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  49.26 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>