More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2224 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  100 
 
 		 386 aa  773    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.59 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  46.46 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.22 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  52.33 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  44.66 
 
 		 432 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  50.3 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  48.75 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  52.17 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  46.11 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  47.9 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  40.36 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  45.92 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  48.96 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  48.38 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  45.54 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  42.38 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0120  type II/IV secretion system protein  43.84 
 
 		 358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  36.68 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  45.18 
 
 		 514 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  45.88 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  45.2 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1297  Flp pilus assembly protein ATPase  46.67 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  46.37 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  46.89 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  43.07 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.12 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.06 
 
 		 624 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.71 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  44.65 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  39.22 
 
 		 594 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  51.02 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  39.8 
 
 		 634 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 472 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  36.63 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  36.63 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  38.68 
 
 		 438 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 438 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.74 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  35.63 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 478 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  38.33 
 
 		 523 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  38 
 
 		 520 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  38 
 
 		 520 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  38 
 
 		 520 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  38.33 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  38.33 
 
 		 521 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  38.33 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  36.99 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  37.88 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.32 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  45.06 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  39.12 
 
 		 638 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 		 569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  37.1 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.39 
 
 		 479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.33 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  43.39 
 
 		 492 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.5 
 
 		 455 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 485 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  35.28 
 
 		 446 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>