More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0537 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  100 
 
 
440 aa  885    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  57.24 
 
 
438 aa  501  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  57.23 
 
 
463 aa  359  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  45.01 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  49.06 
 
 
478 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  58.44 
 
 
444 aa  355  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  48.66 
 
 
477 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  50.14 
 
 
569 aa  350  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  49.86 
 
 
463 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  57.05 
 
 
472 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  55.02 
 
 
572 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  49.59 
 
 
465 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  56.86 
 
 
487 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  50.65 
 
 
594 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  55.48 
 
 
589 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  51.89 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  57.47 
 
 
639 aa  339  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  52.72 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.77 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  50.86 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  46.87 
 
 
467 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  48.6 
 
 
441 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.74 
 
 
472 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  53.55 
 
 
465 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.51 
 
 
455 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  54.58 
 
 
634 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  47.25 
 
 
464 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.24 
 
 
455 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.24 
 
 
455 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  52.98 
 
 
563 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  47.76 
 
 
428 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.72 
 
 
479 aa  329  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  47.76 
 
 
428 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  47.76 
 
 
428 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  47.68 
 
 
476 aa  329  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  45.59 
 
 
455 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  54.28 
 
 
638 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  58.33 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  45.02 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  48.88 
 
 
452 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  44.17 
 
 
462 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.53 
 
 
624 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  49.01 
 
 
474 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
468 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  52.88 
 
 
491 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  47.47 
 
 
477 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  55.07 
 
 
452 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  50.29 
 
 
457 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.8 
 
 
473 aa  322  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  47.75 
 
 
450 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.01 
 
 
449 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  42.59 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  48.16 
 
 
472 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  50.14 
 
 
513 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  52.6 
 
 
455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.15 
 
 
453 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  56.13 
 
 
446 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  52.92 
 
 
455 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  48.16 
 
 
472 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
460 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  50.48 
 
 
438 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  46.78 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  52.27 
 
 
455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  48.36 
 
 
454 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  53.68 
 
 
423 aa  318  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  52.92 
 
 
454 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  52.92 
 
 
454 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  52.92 
 
 
454 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  46.63 
 
 
485 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  48.77 
 
 
677 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  46.29 
 
 
491 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  46.86 
 
 
488 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  46 
 
 
491 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  53.49 
 
 
470 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.72 
 
 
467 aa  317  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.95 
 
 
457 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  47.69 
 
 
449 aa  316  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  52.79 
 
 
423 aa  316  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  46.57 
 
 
500 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  48.86 
 
 
523 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  48.86 
 
 
523 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  46.43 
 
 
412 aa  315  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  45.7 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  48.86 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  48.86 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  48.86 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  48.86 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  46.22 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  46.86 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  54.95 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  47.45 
 
 
454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  46.29 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  48.58 
 
 
515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  54.87 
 
 
568 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  50.64 
 
 
459 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  47.25 
 
 
490 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.2 
 
 
481 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  51.65 
 
 
437 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  47.56 
 
 
491 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>