More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1034 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  100 
 
 		 450 aa  909    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  45.01 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  42.34 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  48.04 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  44.94 
 
 		 572 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  50 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  44.53 
 
 		 569 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 445 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 639 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  43.64 
 
 		 589 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 487 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  49.14 
 
 		 634 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  45.95 
 
 		 594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  45.55 
 
 		 479 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  48.14 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  48.42 
 
 		 491 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  46.81 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  48 
 
 		 563 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  47.89 
 
 		 467 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  43.61 
 
 		 463 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  43.22 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  51.66 
 
 		 478 aa  312  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  47.61 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  51.66 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  41.45 
 
 		 477 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.19 
 
 		 441 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  44.21 
 
 		 470 aa  308  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  41.77 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  41.77 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  41.77 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 624 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  43.08 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  41.84 
 
 		 453 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.51 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.58 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.52 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  47.32 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  44.79 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  47.66 
 
 		 513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 467 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  44 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  48.92 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  41.51 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  39.76 
 
 		 451 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  43.85 
 
 		 677 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  47.02 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  45.48 
 
 		 515 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  47.68 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  47.9 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  45.2 
 
 		 520 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  45.2 
 
 		 521 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  45.2 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  40.36 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  45.2 
 
 		 520 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  45.2 
 
 		 520 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  45.2 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  43.32 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 491 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 491 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.04 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 482 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 492 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  41.58 
 
 		 454 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>