More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0682 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  100 
 
 		 428 aa  862    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  99.77 
 
 		 428 aa  860    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  99.77 
 
 		 428 aa  860    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  54.55 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  54.07 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  53.85 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  53.21 
 
 		 487 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  51.74 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  51.74 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  48.9 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  48.9 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  50.81 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  50.25 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 624 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  48.49 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  53.94 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50.55 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  50.27 
 
 		 521 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  50.27 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  50.27 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  50.27 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  50.27 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  50.27 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  48.2 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  51.09 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  53.74 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  53.16 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  52.3 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  53.16 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  53.74 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  52.3 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  49.46 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  48.59 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  48.33 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  54.13 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  54.13 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  54.43 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.45 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  53.82 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  47.94 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  53.21 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  48.11 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  51.4 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  53.82 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  46.04 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  54.35 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  48.61 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  48.45 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  52.3 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  50 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 442 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  50.28 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  49.44 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  50.29 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  51.94 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  50.71 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  48.11 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  46.85 
 
 		 638 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.07 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  55.62 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  50.14 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  44.34 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  48.09 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  46.84 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.48 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  50.87 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  45.01 
 
 		 634 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.86 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  48.12 
 
 		 454 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.86 
 
 		 455 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.62 
 
 		 472 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  47.16 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  50 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  45.37 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 465 aa  362  9e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.23 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  49.58 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  49.58 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.23 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.02 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  47.25 
 
 		 560 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.28 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50.43 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  47.99 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  45.65 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  49.01 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  44.81 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  49.01 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  49.01 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  48.77 
 
 		 589 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>