More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2160 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  100 
 
 
438 aa  883    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  66.34 
 
 
421 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  66.58 
 
 
421 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  61.62 
 
 
418 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  60.6 
 
 
418 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  60.8 
 
 
418 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  57.63 
 
 
417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0646  type II secretion system protein E  61.98 
 
 
423 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358361  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  51.47 
 
 
450 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  50.79 
 
 
451 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  50.79 
 
 
451 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  49.48 
 
 
455 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  48.55 
 
 
449 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  48.5 
 
 
440 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  49.48 
 
 
454 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  49.48 
 
 
447 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
450 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  49.47 
 
 
447 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  49.48 
 
 
447 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  50.13 
 
 
479 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  49.47 
 
 
446 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  50.68 
 
 
464 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  48.72 
 
 
438 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
450 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
450 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  50.97 
 
 
462 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  49.47 
 
 
447 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  49.47 
 
 
447 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  49.47 
 
 
440 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  49.6 
 
 
472 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  52.96 
 
 
452 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  52.96 
 
 
450 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  49.6 
 
 
469 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  50.38 
 
 
408 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  49.6 
 
 
469 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  48.53 
 
 
438 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  56.29 
 
 
624 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  51.07 
 
 
453 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  49.32 
 
 
460 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  51.76 
 
 
445 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  48.04 
 
 
472 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  55.91 
 
 
452 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  51.35 
 
 
467 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  50.53 
 
 
444 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  51.09 
 
 
463 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  48.42 
 
 
469 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  52.02 
 
 
454 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  46.88 
 
 
473 aa  360  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  49.58 
 
 
463 aa  359  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  53.54 
 
 
468 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  49.21 
 
 
444 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  48.9 
 
 
481 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  50.42 
 
 
408 aa  358  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  51.54 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  56.58 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  52.71 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  48.9 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  48.95 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  52.41 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  52.71 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
455 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  48.94 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  52.71 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  51.62 
 
 
449 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  51.07 
 
 
437 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.71 
 
 
451 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  56.48 
 
 
560 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  48.1 
 
 
456 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  48.26 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  53.01 
 
 
455 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  48.21 
 
 
487 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  48.34 
 
 
677 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50.8 
 
 
437 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  51.63 
 
 
465 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  52.11 
 
 
454 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  52.11 
 
 
454 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  56.45 
 
 
441 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  52.11 
 
 
454 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.78 
 
 
437 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  50.54 
 
 
452 aa  349  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
459 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  55.66 
 
 
468 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  48.93 
 
 
457 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  56.37 
 
 
608 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  51.67 
 
 
437 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  50.27 
 
 
457 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  55.45 
 
 
478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  54.93 
 
 
477 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  53.8 
 
 
458 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  54.17 
 
 
634 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  52.01 
 
 
485 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  47.62 
 
 
563 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  48.16 
 
 
445 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
491 aa  339  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
474 aa  338  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  50.65 
 
 
569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  50.65 
 
 
572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
442 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  46.77 
 
 
449 aa  335  7.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  51.52 
 
 
449 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>