More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0646 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  85.71 
 
 		 418 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  85.02 
 
 		 418 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0646  type II secretion system protein E  100 
 
 		 423 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  81.82 
 
 		 418 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  71.63 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  73.43 
 
 		 421 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  61.98 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  59.4 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  49.47 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  48.74 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  48.48 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  51.82 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  51.79 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  48.99 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  47.87 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  48.74 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  50 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  47.87 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  49.6 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  47.87 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  48.74 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  48.74 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  52.27 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  49.2 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.88 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  49.2 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  46.72 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  49.6 
 
 		 467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  48.04 
 
 		 456 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  46.98 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  47.33 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  48.57 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.33 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 452 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.33 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.33 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  46.56 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  52.92 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  52.87 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  51.36 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  45.3 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.94 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  49.08 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.29 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  48.17 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  50.39 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  51.78 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 444 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 487 aa  355  8.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  51.35 
 
 		 465 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  47.31 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  51.05 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  50 
 
 		 473 aa  352  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 482 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  47.3 
 
 		 485 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  45.75 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  45.01 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  52.3 
 
 		 521 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  52.59 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  51.75 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  48.27 
 
 		 484 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  52.05 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  52.3 
 
 		 520 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  52.3 
 
 		 520 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  52.3 
 
 		 520 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  52.3 
 
 		 523 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  52.3 
 
 		 523 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  46.98 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  50.44 
 
 		 492 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  53.09 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  48 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  51.44 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  51.17 
 
 		 482 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  46.56 
 
 		 480 aa  349  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  52 
 
 		 468 aa  348  9e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  51.75 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  47.2 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  46.63 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  52.58 
 
 		 624 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  49.54 
 
 		 572 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  50.72 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  47.16 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  51.17 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 491 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>