More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2324 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  100 
 
 
444 aa  902    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  99.77 
 
 
444 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  58.43 
 
 
446 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  58.95 
 
 
469 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  58.66 
 
 
447 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  58.71 
 
 
469 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  58.66 
 
 
447 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  58.66 
 
 
454 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  58.66 
 
 
447 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  57.97 
 
 
455 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  57.97 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  57.74 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  57.88 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  57.74 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  57.74 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  57.77 
 
 
450 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  59.71 
 
 
440 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  56.52 
 
 
438 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  58 
 
 
451 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  57.74 
 
 
447 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  58 
 
 
451 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  56.25 
 
 
440 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  51.95 
 
 
449 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  65.18 
 
 
335 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  65.18 
 
 
335 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  50 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  49.5 
 
 
464 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.04 
 
 
453 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
462 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.52 
 
 
455 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.52 
 
 
455 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
456 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  44.93 
 
 
460 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  48.25 
 
 
459 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
454 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  47.28 
 
 
451 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.75 
 
 
444 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  48.71 
 
 
452 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
454 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.52 
 
 
455 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
454 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.99 
 
 
455 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.71 
 
 
455 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.84 
 
 
455 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.58 
 
 
450 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  45.85 
 
 
454 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.99 
 
 
455 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.45 
 
 
449 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  45 
 
 
449 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  49.13 
 
 
469 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
445 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.41 
 
 
624 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  46.46 
 
 
441 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  51.71 
 
 
442 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  44.91 
 
 
454 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  51.83 
 
 
468 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.87 
 
 
473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  49.86 
 
 
479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.45 
 
 
472 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  47.75 
 
 
463 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  47.91 
 
 
408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  46.02 
 
 
457 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.15 
 
 
467 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  45.9 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  43.81 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  48.94 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  43.61 
 
 
472 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  49.71 
 
 
465 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
442 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  44.09 
 
 
491 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  48.86 
 
 
463 aa  352  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  47.55 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  45.41 
 
 
452 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  45.95 
 
 
437 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  49.62 
 
 
421 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  50.14 
 
 
485 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  48.85 
 
 
421 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  51.31 
 
 
452 aa  349  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  45.32 
 
 
437 aa  349  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  46.59 
 
 
560 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  45.07 
 
 
437 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
467 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  48.99 
 
 
572 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  47.23 
 
 
495 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  50.41 
 
 
471 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  46.91 
 
 
418 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  50.95 
 
 
608 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  47.73 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  47.85 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  45.5 
 
 
457 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  48.02 
 
 
508 aa  342  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  49.3 
 
 
465 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.26 
 
 
468 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  49.44 
 
 
458 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.83 
 
 
634 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
498 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  43.83 
 
 
638 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  45.48 
 
 
677 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>