More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3656 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  86.48 
 
 		 450 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  80.37 
 
 		 447 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  92.5 
 
 		 440 aa  819    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  79.91 
 
 		 447 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  80.75 
 
 		 455 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  79.58 
 
 		 447 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  79.21 
 
 		 446 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  76.17 
 
 		 438 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  86.95 
 
 		 451 aa  747    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  80.84 
 
 		 469 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  79.11 
 
 		 450 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  878    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  79.11 
 
 		 450 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  80.05 
 
 		 454 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  79.11 
 
 		 450 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  86.95 
 
 		 451 aa  747    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  80.37 
 
 		 469 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  79.91 
 
 		 447 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  79.91 
 
 		 447 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  74.28 
 
 		 440 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  65.13 
 
 		 449 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  82.22 
 
 		 335 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  82.22 
 
 		 335 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  57.88 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  57.88 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  49.26 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  51.22 
 
 		 624 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  47.68 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  47.87 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  48.69 
 
 		 452 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  48.2 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  52.69 
 
 		 608 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  48.66 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  54.52 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  52.41 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.1 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  46.87 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.01 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  50.65 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  48.72 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  46.34 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  47.3 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  51.1 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  44.87 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  46.34 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  46.34 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  50 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  52.45 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  48.48 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  48.48 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  49.22 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  48.48 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.01 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  48.48 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  49.23 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  49.07 
 
 		 463 aa  362  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  51.34 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  51.34 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  48.39 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.93 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  51.88 
 
 		 634 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  49.73 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.44 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  49.74 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.97 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  53.5 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  49.61 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 677 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  48.34 
 
 		 463 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  52.07 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  51.52 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  44.6 
 
 		 521 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  46.32 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 508 aa  352  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  48.56 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  44.16 
 
 		 638 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  44.99 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  45.32 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  51.48 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  51.01 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  45.64 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 491 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  45.68 
 
 		 498 aa  349  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  48.4 
 
 		 488 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  43.72 
 
 		 572 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  51.69 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  48.25 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  44.89 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>